Yogyakarta, akhir 1990-an. Suasana kampus di Yogyakarta agak tegang setelah penangkapan tiga mahasiswa yang menyebarkan buku terlarang. Biru Laut (Reza Rahadian), mahasiswa yang gemar membaca dan menulis, memutuskan bergabung dengan kelompok studi Winatra. Bersama Daniel (Kevin Julio), Alex (Ben Nugroho), Sunu (Dewa Dayana), dan sahabat-sahabatnya, Laut menyadari bahwa memperjuangkan kebebasan berekspresi bukanlah perkara mudah. Namun mereka terus bergerak, hingga suatu malam Laut dan sejumlah kawannya menghilang tanpa kabar. Bapak (Arswendy Bening Swara), Ibu (Christine Hakim), adiknya Asmara Jati (Yunita Siregar), serta sahabat-sahabat Laut kemudian menjalani pencarian panjang untuk menemukan jawaban tentang mereka yang hilang.